Работа файла .htaccess распространяется на папку и подпапки в которых он размещён.
Запрет всех файлов в папке
В закрываемой папке нужно создать файл .htaccess со следующим содержанием:
Deny from all
Запретить доступ по определённому IP
Order Allow,Deny
Allow from all
Deny from 127.0.0.1
Разрешить доступ по определённому IP
Order Deny,Allow
Deny from all
Allow from 127.0.0.1